Экспозиция посвящена советской авиации времен ВОВ. Е.Н. Преображенский - Герой Советского Союза, генерал-полковник авиации, лично командовал бомбардировками Берлина летом 1941 года.

В одном из залов Казенной палаты представлены памятники церковной деревянной скульптуры XVIII–XIX веков из собрания Кирилло-Белозерского музея-заповедника.

В церкви Введения Марии во храм размещена выставка тканей, произведённых в Италии, Франции, Персии, Турции. Часть дорогих материй приобреталась на монастырский счёт, часть ‒ поступала в обитель в качестве вкладов.

Выставка рассказывает о быте крестьян, живших когда-то в окрестностях монастыря, деятельность которого была тесно связана с жителями ферапонтовской округи.

Церковь возведена кирилловскими мастерами в 1641 году. Главная святыня храма – мощи преподобного Мартиниана – находятся под спудом в нише у северной стены.

На первом этаже Архимандричьего корпуса представлены рукописные книги XV-XX веков, печатные кириллические издания, книги гражданской печати XVIII–первой трети XIX века

В городе Кириллове, ул. Гагарина, д. 103 в начале ХХ века в доме жил врач Иоаким Яковлевич Нодельман. Интерьер показывает быт того времени. Размещаются временные выставки

Собор Рождества Богородицы 1490 года постройки (каменный). В 1502 году собор внутри был расписан Дионисием с сыновьями.Собор с уникальной стенописью включен в список ЮНЕСКО.

Основную часть «открытого» фонда составляет коллекция народной керамики: чернолощеные сосуды, красноглиняные пивные корчаги, горшки, кринки, разливы, миски, латки и другая глиняная посуда конца XIX − начала XX веков.

Основная часть экспонируемых материалов относится ко времени средневековья -это находки из летописного города Белоозера, могильников Нефедьево и Кемского некрополя, материалы раскопок монастыря