Коллекция дерева Кирилло-Белозерского музея-заповедника насчитывает более 3900 единиц хранения. Ее формирование осуществлялось на протяжении всей истории музея.
Основная часть предметов из дерева собрана в 1960–1990-е годы. В этот период главным источником пополнения фондов музея были экспедиции, во время которых обследованы территории бывшего Кирилловского уезда и прилегающие к нему земли, ранее входившие в состав Новгородской, Олонецкой, Вологодской губерний. В настоящее время территория Кирилловского, Белозерского, Вашкинского, Вожегодского, Вытегорского, Тарногского районов Вологодской области и Каргопольского района Архангельской области. В 2001–2006 годах экспедиционная деятельность была возобновлена. В этот период музей организовал экспедиции в Вожегодский, Вашкинский, Тарногский районы Вологодской области, а так же обследован куст деревень на территории Кирилловского района. Ценность предметов, приобретенных в экспедициях в том, что практически о каждом из них есть полезная для исследователей информация о месте бытования, об использовании в обиходе, о мастерах региона. Поскольку не все экспедиции имеют полный документальный материал, т.е. полевую опись, дневник, отчёт, то круг обследованных экспедициями деревень восстанавливался по актам поступлений. В результате число населённых мест, исследованных экспедициями, значительно меньше того, что было на самом деле. Участники кратких выездов не ограничивались в своей работе только приобретением ранее найденного материала. Они продолжали обследование деревень. Порой их результаты были ничуть не меньшими, чем, те, что получены в длительных экспедициях. Результатами труда не одного десятка музейных сотрудников стали обширные коллекции, в которых нашла отражение материальная, художественная культура населения исследованного региона. Значительное число исторических документов поступило в музей в результате неутомимой поисковой работы.
